Nieprawidłowe stężenie AFP w surowicy ciężarnej wykraczające poza mediany ustalone dla danego wieku ciążowego, mogą korelować z niektórymi aberracjami chromosomalnymi lub z otwartymi wadami cewy nerwowej.
AFP u ciężarnych zawsze jest wyższe niż normy aboratoryjne ustalone dla populacji. Wynik po otrzymaniu wartości ilościowych w laboratorium przeliczany jest dla mediany dla ciąży (odchylenie standardowe, MoM). Wynik stężenia AFP powinien się mieścić w przedziale 0,5 – 2,5 MoM.
Wg rekomendacji badanie powinno być pobrane między 16-18 tygodniem ciąży, istnieje natomiast możliwość oceny AFP u ciężarnej pomiędzy 15-20 tygodniem ciąży.